Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms