Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK4Q6UW60 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms