Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC171Q6TFL3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms