Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC174Q6PII3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC174Q6PII3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms