Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NANOGP8Q6NSW7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms