Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCSD1Q6JBY9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms