Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALRD1Q5VYJ5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms