Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 AC003956.1-201ENST00000598450 356 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC1Q5VXU3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms