Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR78Q5VTH9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms