Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRIP1Q5VSL9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRIP1Q5VSL9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms