Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDSS1Q5T2R2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDSS1Q5T2R2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms