Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SDK2Q58EX2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms