Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ANKRD39Q53RE8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms