Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCBP3Q53F19 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCBP3Q53F19 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms