Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP41Q3LFD5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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