Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q1T7F1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q1T7F1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q1T7F1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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