Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN1Q16658 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FSCN1Q16658 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms