Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRA6Q16445 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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