Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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