Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 PPP1R11-202ENST00000376763 1464 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.637e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 PPP1R11-203ENST00000376765 1536 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.767e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.237e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.327e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.181e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMBIM1-211ENST00000440422 659 ntTSL 525.53■■□□□ 1.683e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.153e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMBIM1-213ENST00000444183 526 ntTSL 514.91□□□□□ -0.023e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMBIM1-217ENST00000453281 534 ntTSL 214.91□□□□□ -0.023e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMBIM1-218ENST00000453776 561 ntTSL 314.59□□□□□ -0.073e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMBIM1-208ENST00000434015 580 ntTSL 314.35□□□□□ -0.113e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.193e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMBIM1-207ENST00000429501 677 ntTSL 513.85□□□□□ -0.193e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMBIM1-220ENST00000466012 572 ntTSL 513.84□□□□□ -0.193e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMBIM1-210ENST00000439306 631 ntTSL 513.2□□□□□ -0.33e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMBIM1-223ENST00000495113 596 ntTSL 213.19□□□□□ -0.33e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMBIM1-206ENST00000425694 569 ntTSL 213.19□□□□□ -0.33e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMBIM1-216ENST00000451181 464 ntTSL 513.14□□□□□ -0.313e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMBIM1-203ENST00000413976 348 ntTSL 412.69□□□□□ -0.383e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMBIM1-212ENST00000444000 571 ntTSL 412.39□□□□□ -0.433e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMBIM1-204ENST00000418569 589 ntTSL 311.89□□□□□ -0.513e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMBIM1-209ENST00000437694 992 ntTSL 211.8□□□□□ -0.523e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMBIM1-215ENST00000445635 1251 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.63e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMBIM1-214ENST00000444881 2936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.633e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 CPSF7-213ENST00000494016 656 ntTSL 26.28□□□□□ -1.41e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.412e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.162e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 DHCR7-212ENST00000534795 979 ntTSL 1 (best)14.98□□□□□ -0.012e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 SCARB1-209ENST00000545305 851 ntTSL 215.02■□□□□ -02e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.353e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 TUBA1C-209ENST00000552448 1800 ntTSL 311.33□□□□□ -0.63e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 TUBA1C-202ENST00000541364 1695 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.753e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 TUBA1C-210ENST00000639419 1075 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.753e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LMBR1-212ENST00000448926 3629 ntTSL 24.23□□□□□ -1.739e-11■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 WDR26-203ENST00000445239 784 ntTSL 55.94□□□□□ -1.462e-13■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 URM1-203ENST00000372853 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.68e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 URM1-204ENST00000452446 2944 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.778e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 URM1-202ENST00000372850 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.98e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 MAP4-201ENST00000335271 1564 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.79■□□□□ 0.283e-7■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 HMG20B-209ENST00000470356 806 ntTSL 1 (best)34.89■■■■□ 3.189e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LRRC14-204ENST00000528528 1408 ntTSL 332.58■■■□□ 2.819e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 RALY-205ENST00000442805 871 ntTSL 528.46■■■□□ 2.156e-9■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.069e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.919e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NOL4L-209ENST00000485364 885 ntTSL 1 (best)26.65■■□□□ 1.862e-10■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NOL4L-201ENST00000201961 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 326.32■■□□□ 1.82e-10■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 HMG20B-201ENST00000262949 886 ntTSL 525.72■■□□□ 1.719e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SMARCB1-205ENST00000417137 889 ntTSL 325.58■■□□□ 1.693e-10■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.69e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 UBALD1-207ENST00000591113 659 ntTSL 525.01■■□□□ 1.599e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.563e-10■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 HMG20B-205ENST00000435022 616 ntTSL 524.79■■□□□ 1.569e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.564e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.559e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 HMG20B-203ENST00000416526 711 ntTSL 324.31■■□□□ 1.489e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 HMG20B-206ENST00000453933 759 ntTSL 224.23■■□□□ 1.479e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ARHGAP4-223ENST00000494397 1752 ntTSL 524.04■■□□□ 1.449e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.444e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 URGCP-203ENST00000426198 885 ntTSL 223.82■■□□□ 1.44e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 URGCP-211ENST00000477768 500 ntTSL 423.82■■□□□ 1.44e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 FAM160B2-211ENST00000498344 917 ntTSL 223.66■■□□□ 1.389e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 TOP3B-205ENST00000434517 736 ntTSL 523.63■■□□□ 1.374e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 HMG20B-204ENST00000417382 561 ntTSL 423.5■■□□□ 1.359e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 FDFT1-220ENST00000531733 712 ntTSL 223.33■■□□□ 1.334e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PTP4A3-205ENST00000523147 558 ntTSL 523.31■■□□□ 1.329e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.319e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 FAM160B2-202ENST00000427751 932 ntTSL 523.16■■□□□ 1.39e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.273e-10■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.279e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LRRC14-206ENST00000529995 940 ntTSL 222.96■■□□□ 1.279e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.244e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.229e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.184e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.179e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CCT7-204ENST00000409924 567 ntTSL 322.3■■□□□ 1.169e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CCT7-211ENST00000480489 527 ntTSL 222.3■■□□□ 1.169e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SLC26A6-214ENST00000462009 825 ntTSL 321.96■■□□□ 1.111e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.099e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.049e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CCT7-203ENST00000399032 593 ntTSL 421.54■■□□□ 1.049e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.023e-10■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ARHGAP4-217ENST00000466928 840 ntTSL 220.89■□□□□ 0.939e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 MEF2D-205ENST00000475587 1627 ntTSL 520.84■□□□□ 0.939e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.889e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.849e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.833e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SCRIB-204ENST00000525051 1685 ntTSL 1 (best)20.13■□□□□ 0.819e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LMBR1L-209ENST00000548983 522 ntTSL 419.88■□□□□ 0.779e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.779e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 FAM229A-203ENST00000428500 362 ntAPPRIS ALT2 TSL 219.81■□□□□ 0.769e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.769e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.759e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 FDFT1-217ENST00000530337 741 ntTSL 319.73■□□□□ 0.754e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 FAM229A-202ENST00000416512 2759 ntTSL 1 (best)19.73■□□□□ 0.759e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LMBR1L-214ENST00000550137 529 ntTSL 419.63■□□□□ 0.739e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LMBR1L-217ENST00000551115 965 ntTSL 1 (best)19.63■□□□□ 0.739e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LMBR1L-203ENST00000457164 1081 ntTSL 219.63■□□□□ 0.739e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LMBR1L-206ENST00000547675 581 ntTSL 519.63■□□□□ 0.739e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.739e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.724e-8■■■□□ 18.2
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