Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3GAP1Q15042 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms