Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERC3Q15034 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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