Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMD6Q15008 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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