Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39AQ14964 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms