Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF235Q14590 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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ZNF235Q14590 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
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ZNF235Q14590 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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ZNF235Q14590 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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ZNF235Q14590 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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ZNF235Q14590 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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ZNF235Q14590 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF235Q14590 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms