Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM29Q14134 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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