Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMB3Q13751 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMB3Q13751 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms