Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3CQ13748 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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