Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C1orf61Q13536 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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C1orf61Q13536 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C1orf61Q13536 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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