Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME3Q13232 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME3Q13232 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME3Q13232 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME3Q13232 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME3Q13232 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME3Q13232 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME3Q13232 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME3Q13232 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NME3Q13232 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NME3Q13232 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NME3Q13232 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NME3Q13232 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
NME3Q13232 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
NME3Q13232 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME3Q13232 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME3Q13232 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME3Q13232 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME3Q13232 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME3Q13232 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME3Q13232 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NME3Q13232 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME3Q13232 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME3Q13232 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME3Q13232 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME3Q13232 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME3Q13232 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME3Q13232 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
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