Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PAPPAQ13219 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAPPAQ13219 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms