Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
STX4Q12846 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
STX4Q12846 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
STX4Q12846 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
STX4Q12846 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
STX4Q12846 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
STX4Q12846 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
STX4Q12846 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
STX4Q12846 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
STX4Q12846 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
STX4Q12846 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
STX4Q12846 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
STX4Q12846 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
STX4Q12846 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
STX4Q12846 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
STX4Q12846 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
STX4Q12846 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
STX4Q12846 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STX4Q12846 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STX4Q12846 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STX4Q12846 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STX4Q12846 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STX4Q12846 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STX4Q12846 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STX4Q12846 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STX4Q12846 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STX4Q12846 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STX4Q12846 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STX4Q12846 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
STX4Q12846 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STX4Q12846 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
STX4Q12846 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
STX4Q12846 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STX4Q12846 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
STX4Q12846 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STX4Q12846 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
STX4Q12846 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STX4Q12846 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STX4Q12846 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STX4Q12846 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STX4Q12846 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STX4Q12846 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STX4Q12846 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
STX4Q12846 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
STX4Q12846 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STX4Q12846 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
STX4Q12846 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
STX4Q12846 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
STX4Q12846 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STX4Q12846 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
STX4Q12846 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
STX4Q12846 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
STX4Q12846 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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