Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

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Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 TRM732YMR259C 4263 nt1.62□□□□□ -2.15
HER1Q12276 PBY1YBR094W 2262 nt1.61□□□□□ -2.15
HER1Q12276 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.6□□□□□ -2.15
HER1Q12276 CTF4YPR135W 2784 nt1.59□□□□□ -2.15
HER1Q12276 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.59□□□□□ -2.15
HER1Q12276 YPL044CYPL044C 549 nt1.59□□□□□ -2.15
HER1Q12276 COG4YPR105C 2586 nt1.59□□□□□ -2.15
HER1Q12276 PKH2YOL100W 3246 nt1.59□□□□□ -2.16
HER1Q12276 MEC1YBR136W 7107 nt1.59□□□□□ -2.16
HER1Q12276 SLI15YBR156C 2097 nt1.59□□□□□ -2.16
HER1Q12276 KAP122YGL016W 3246 nt1.57□□□□□ -2.16
HER1Q12276 DNF3YMR162C 4971 nt1.57□□□□□ -2.16
HER1Q12276 RPS30BYOR182C 192 nt1.57□□□□□ -2.16
HER1Q12276 SFB2YNL049C 2631 nt1.57□□□□□ -2.16
HER1Q12276 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.56□□□□□ -2.16
HER1Q12276 SXM1YDR395W 2835 nt1.55□□□□□ -2.16
HER1Q12276 COX12YLR038C 252 nt1.55□□□□□ -2.16
HER1Q12276 CFT1YDR301W 4074 nt1.55□□□□□ -2.16
HER1Q12276 BST1YFL025C 3090 nt1.55□□□□□ -2.16
HER1Q12276 MDS3YGL197W 4464 nt1.54□□□□□ -2.16
HER1Q12276 PAA1YDR071C 576 nt1.54□□□□□ -2.16
HER1Q12276 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.54□□□□□ -2.16
HER1Q12276 YOR102WYOR102W 351 nt1.54□□□□□ -2.16
HER1Q12276 SPC110YDR356W 2835 nt1.54□□□□□ -2.16
HER1Q12276 NUP192YJL039C 5052 nt1.53□□□□□ -2.16
HER1Q12276 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.53□□□□□ -2.16
HER1Q12276 YJL022WYJL022W 309 nt1.53□□□□□ -2.16
HER1Q12276 TRM3YDL112W 4311 nt1.53□□□□□ -2.16
HER1Q12276 PIK1YNL267W 3201 nt1.52□□□□□ -2.17
HER1Q12276 HUG1YML058W-A 207 nt1.52□□□□□ -2.17
HER1Q12276 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.51□□□□□ -2.17
HER1Q12276 POL5YEL055C 3069 nt1.51□□□□□ -2.17
HER1Q12276 CCH1YGR217W 6120 nt1.51□□□□□ -2.17
HER1Q12276 APL1YJR005W 2103 nt1.51□□□□□ -2.17
HER1Q12276 TTI1YKL033W 3117 nt1.51□□□□□ -2.17
HER1Q12276 NUT1YGL151W 3399 nt1.5□□□□□ -2.17
HER1Q12276 FIG2YCR089W 4830 nt1.5□□□□□ -2.17
HER1Q12276 EMC5YIL027C 426 nt1.49□□□□□ -2.17
HER1Q12276 YDL206WYDL206W 2289 nt1.49□□□□□ -2.17
HER1Q12276 YCS4YLR272C 3531 nt1.48□□□□□ -2.17
HER1Q12276 STF2YGR008C 255 nt1.48□□□□□ -2.17
HER1Q12276 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.48□□□□□ -2.17
HER1Q12276 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt1.48□□□□□ -2.17
HER1Q12276 PMD1YER132C 5262 nt1.47□□□□□ -2.17
HER1Q12276 RAD50YNL250W 3939 nt1.47□□□□□ -2.17
HER1Q12276 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.47□□□□□ -2.17
HER1Q12276 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.46□□□□□ -2.18
HER1Q12276 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.46□□□□□ -2.18
HER1Q12276 COA6YMR244C-A 315 nt1.46□□□□□ -2.18
HER1Q12276 YNL211CYNL211C 261 nt1.46□□□□□ -2.18
HER1Q12276 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.46□□□□□ -2.18
HER1Q12276 ALY2YJL084C 3141 nt1.46□□□□□ -2.18
HER1Q12276 PET127YOR017W 2403 nt1.46□□□□□ -2.18
HER1Q12276 PRP5YBR237W 2550 nt1.45□□□□□ -2.18
HER1Q12276 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.45□□□□□ -2.18
HER1Q12276 BRR2YER172C 6492 nt1.44□□□□□ -2.18
HER1Q12276 CDC31YOR257W 486 nt1.44□□□□□ -2.18
HER1Q12276 EST2YLR318W 2655 nt1.44□□□□□ -2.18
HER1Q12276 CHS1YNL192W 3396 nt1.44□□□□□ -2.18
HER1Q12276 HKR1YDR420W 5409 nt1.43□□□□□ -2.18
HER1Q12276 UFD2YDL190C 2886 nt1.43□□□□□ -2.18
HER1Q12276 PAN2YGL094C 3348 nt1.43□□□□□ -2.18
HER1Q12276 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.43□□□□□ -2.18
HER1Q12276 FYV8YGR196C 2454 nt1.42□□□□□ -2.18
HER1Q12276 YBR178WYBR178W 375 nt1.42□□□□□ -2.18
HER1Q12276 MMS4YBR098W 2076 nt1.42□□□□□ -2.18
HER1Q12276 YLL054CYLL054C 2532 nt1.42□□□□□ -2.18
HER1Q12276 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt1.41□□□□□ -2.18
HER1Q12276 SLX4YLR135W 2247 nt1.41□□□□□ -2.18
HER1Q12276 MSN5YDR335W 3675 nt1.41□□□□□ -2.18
HER1Q12276 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.4□□□□□ -2.19
HER1Q12276 SMC4YLR086W 4257 nt1.4□□□□□ -2.19
HER1Q12276 SEC21YNL287W 2808 nt1.39□□□□□ -2.19
HER1Q12276 YLR422WYLR422W 5799 nt1.39□□□□□ -2.19
HER1Q12276 snR14snR14 160 nt1.39□□□□□ -2.19
HER1Q12276 RSM22YKL155C 1887 nt1.39□□□□□ -2.19
HER1Q12276 YAR009CYAR009C 3591 nt1.38□□□□□ -2.19
HER1Q12276 BFR2YDR299W 1605 nt1.38□□□□□ -2.19
HER1Q12276 SSK2YNR031C 4740 nt1.38□□□□□ -2.19
HER1Q12276 CDC39YCR093W 6327 nt1.37□□□□□ -2.19
HER1Q12276 YGL182CYGL182C 324 nt1.37□□□□□ -2.19
HER1Q12276 CHS6YJL099W 2241 nt1.36□□□□□ -2.19
HER1Q12276 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt1.36□□□□□ -2.19
HER1Q12276 YLL020CYLL020C 306 nt1.36□□□□□ -2.19
HER1Q12276 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.36□□□□□ -2.19
HER1Q12276 AZF1YOR113W 2745 nt1.36□□□□□ -2.19
HER1Q12276 UTP8YGR128C 2142 nt1.36□□□□□ -2.19
HER1Q12276 CAT8YMR280C 4302 nt1.35□□□□□ -2.19
HER1Q12276 SMC1YFL008W 3678 nt1.35□□□□□ -2.19
HER1Q12276 COX5BYIL111W 456 nt1.35□□□□□ -2.19
HER1Q12276 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.35□□□□□ -2.19
HER1Q12276 YBL109WYBL109W 336 nt1.35□□□□□ -2.19
HER1Q12276 NUP188YML103C 4968 nt1.35□□□□□ -2.19
HER1Q12276 OST4YDL232W 111 nt1.34□□□□□ -2.19
HER1Q12276 CMC4YMR194C-B 222 nt1.34□□□□□ -2.19
HER1Q12276 YBR099CYBR099C 384 nt1.34□□□□□ -2.19
HER1Q12276 STB6YKL072W 2301 nt1.34□□□□□ -2.2
HER1Q12276 MSH3YCR092C 3057 nt1.34□□□□□ -2.2
HER1Q12276 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.33□□□□□ -2.2
HER1Q12276 YLR282CYLR282C 342 nt1.33□□□□□ -2.2
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