Protein–RNA interactions for Protein: Q12215

WSC3, Cell wall integrity and stress response component 3, yeastyeast

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
WSC3Q12215 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.9□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.9□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.9□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.9□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 snR190snR190 190 nt2.9□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 STT4YLR305C 5703 nt2.9□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 YGR067CYGR067C 2415 nt2.9□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 BMS1YPL217C 3552 nt2.89□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 YCS4YLR272C 3531 nt2.89□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 ESL1YIL151C 3357 nt2.89□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 MET18YIL128W 3099 nt2.89□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 TDA9YML081W 3756 nt2.88□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 CTR9YOL145C 3234 nt2.87□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 snR69snR69 101 nt2.87□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt2.87□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 STE6YKL209C 3873 nt2.87□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 BUL2YML111W 2763 nt2.87□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 ECM21YBL101C 3354 nt2.86□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 snR40snR40 97 nt2.86□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 NUT1YGL151W 3399 nt2.85□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 SSM4YIL030C 3960 nt2.84□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt2.84□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt2.84□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 YBT1YLL048C 4986 nt2.84□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 NMD2YHR077C 3270 nt2.84□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 YIL169CYIL169C 2988 nt2.84□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 RIF1YBR275C 5751 nt2.84□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 TAF1YGR274C 3201 nt2.83□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 SSD1YDR293C 3753 nt2.83□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 POL2YNL262W 6669 nt2.83□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 SSN2YDR443C 4263 nt2.82□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 PMR1YGL167C 2853 nt2.82□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 MSH6YDR097C 3729 nt2.82□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 TOF1YNL273W 3717 nt2.82□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.81□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.81□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 FLO1YAR050W 4614 nt2.8□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 AUS1YOR011W 4185 nt2.8□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 TCB2YNL087W 3537 nt2.8□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 GYP5YPL249C 2685 nt2.79□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 RTT101YJL047C 2529 nt2.79□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 TFC3YAL001C 3483 nt2.78□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 TRS120YDR407C 3870 nt2.78□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 STO1YMR125W 2586 nt2.78□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 YOR296WYOR296W 3870 nt2.78□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 SYH1YPL105C 2550 nt2.78□□□□□ -1.96
WSC3Q12215 YAR009CYAR009C 3591 nt2.77□□□□□ -1.97
WSC3Q12215 ULP2YIL031W 3105 nt2.77□□□□□ -1.97
WSC3Q12215 TAO3YIL129C 7131 nt2.77□□□□□ -1.97
WSC3Q12215 RSE1YML049C 4086 nt2.77□□□□□ -1.97
WSC3Q12215 RPN1YHR027C 2982 nt2.76□□□□□ -1.97
WSC3Q12215 NUP100YKL068W 2880 nt2.76□□□□□ -1.97
WSC3Q12215 SEC3YER008C 4011 nt2.76□□□□□ -1.97
WSC3Q12215 CAT8YMR280C 4302 nt2.75□□□□□ -1.97
WSC3Q12215 SNQ2YDR011W 4506 nt2.75□□□□□ -1.97
WSC3Q12215 YEL025CYEL025C 3567 nt2.74□□□□□ -1.97
WSC3Q12215 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt2.73□□□□□ -1.97
WSC3Q12215 YSP2YDR326C 4317 nt2.73□□□□□ -1.97
WSC3Q12215 GCN1YGL195W 8019 nt2.72□□□□□ -1.97
WSC3Q12215 CSE1YGL238W 2883 nt2.72□□□□□ -1.97
WSC3Q12215 DYN1YKR054C 12279 nt2.72□□□□□ -1.97
WSC3Q12215 SPO14YKR031C 5052 nt2.7□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YLR422WYLR422W 5799 nt2.7□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 CDC25YLR310C 4770 nt2.7□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 SEC8YPR055W 3198 nt2.68□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 IRE1YHR079C 3348 nt2.68□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 SXM1YDR395W 2835 nt2.68□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 CSR2YPR030W 3366 nt2.67□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 MSH3YCR092C 3057 nt2.67□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt2.67□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YER138CYER138C 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YER160CYER160C 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YJR027WYJR027W 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YML039WYML039W 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YML045WYML045W 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YMR050CYMR050C 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.65□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.65□□□□□ -1.98
WSC3Q12215 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.65□□□□□ -1.99
WSC3Q12215 SIR4YDR227W 4077 nt2.64□□□□□ -1.99
WSC3Q12215 AMS1YGL156W 3252 nt2.64□□□□□ -1.99
WSC3Q12215 DGR1YNL130C-A 147 nt2.64□□□□□ -1.99
WSC3Q12215 RGC1YPR115W 3252 nt2.64□□□□□ -1.99
WSC3Q12215 YSP1YHR155W 3687 nt2.64□□□□□ -1.99
WSC3Q12215 YEF3YLR249W 3135 nt2.62□□□□□ -1.99
WSC3Q12215 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt2.62□□□□□ -1.99
WSC3Q12215 KIP1YBL063W 3336 nt2.62□□□□□ -1.99
WSC3Q12215 MSN5YDR335W 3675 nt2.62□□□□□ -1.99
WSC3Q12215 IRC20YLR247C 4671 nt2.6□□□□□ -1.99
WSC3Q12215 MSB1YOR188W 3414 nt2.59□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 104.5 ms