Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 CAT8YMR280C 4302 nt1.86□□□□□ -2.11
SSF2Q12153 BPH1YCR032W 6504 nt1.85□□□□□ -2.11
SSF2Q12153 YJL150WYJL150W 303 nt1.85□□□□□ -2.11
SSF2Q12153 ANS1YHR126C 480 nt1.84□□□□□ -2.11
SSF2Q12153 RPL33BYOR234C 324 nt1.84□□□□□ -2.11
SSF2Q12153 snR46snR46 197 nt1.84□□□□□ -2.11
SSF2Q12153 snR52snR52 92 nt1.84□□□□□ -2.11
SSF2Q12153 RSM22YKL155C 1887 nt1.84□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 STO1YMR125W 2586 nt1.83□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 CLU1YMR012W 3834 nt1.83□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 PRP39YML046W 1890 nt1.82□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 SWI4YER111C 3282 nt1.82□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 AZF1YOR113W 2745 nt1.82□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.82□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 YLR294CYLR294C 330 nt1.82□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 YNL211CYNL211C 261 nt1.82□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 SXM1YDR395W 2835 nt1.82□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 SET3YKR029C 2256 nt1.81□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 PAA1YDR071C 576 nt1.81□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 NUP145YGL092W 3954 nt1.81□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 EAF1YDR359C 2949 nt1.8□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 ROM2YLR371W 4071 nt1.8□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 APL3YBL037W 3078 nt1.8□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 FIG2YCR089W 4830 nt1.8□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 HAL9YOL089C 3093 nt1.8□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 IRA1YBR140C 9279 nt1.79□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 EST2YLR318W 2655 nt1.79□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 CDC25YLR310C 4770 nt1.79□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 TTI1YKL033W 3117 nt1.79□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 YEL073CYEL073C 324 nt1.79□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 CHS1YNL192W 3396 nt1.78□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.78□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.78□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 WAR1YML076C 2835 nt1.78□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 VPS15YBR097W 4365 nt1.78□□□□□ -2.12
SSF2Q12153 POL5YEL055C 3069 nt1.77□□□□□ -2.13
SSF2Q12153 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.77□□□□□ -2.13
SSF2Q12153 COX12YLR038C 252 nt1.76□□□□□ -2.13
SSF2Q12153 RPS30BYOR182C 192 nt1.76□□□□□ -2.13
SSF2Q12153 CDC31YOR257W 486 nt1.75□□□□□ -2.13
SSF2Q12153 MDS3YGL197W 4464 nt1.75□□□□□ -2.13
SSF2Q12153 MSH3YCR092C 3057 nt1.75□□□□□ -2.13
SSF2Q12153 YNL338WYNL338W 159 nt1.74□□□□□ -2.13
SSF2Q12153 SEC3YER008C 4011 nt1.74□□□□□ -2.13
SSF2Q12153 TRS65YGR166W 1683 nt1.74□□□□□ -2.13
SSF2Q12153 YLR419WYLR419W 4308 nt1.73□□□□□ -2.13
SSF2Q12153 COY1YKL179C 2040 nt1.73□□□□□ -2.13
SSF2Q12153 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.73□□□□□ -2.13
SSF2Q12153 MSN5YDR335W 3675 nt1.72□□□□□ -2.13
SSF2Q12153 CMC4YMR194C-B 222 nt1.72□□□□□ -2.13
SSF2Q12153 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.7□□□□□ -2.14
SSF2Q12153 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.7□□□□□ -2.14
SSF2Q12153 PMD1YER132C 5262 nt1.7□□□□□ -2.14
SSF2Q12153 NOP9YJL010C 2001 nt1.69□□□□□ -2.14
SSF2Q12153 NUP188YML103C 4968 nt1.68□□□□□ -2.14
SSF2Q12153 PMP1YCR024C-A 123 nt1.68□□□□□ -2.14
SSF2Q12153 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.68□□□□□ -2.14
SSF2Q12153 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.68□□□□□ -2.14
SSF2Q12153 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.68□□□□□ -2.14
SSF2Q12153 SSK2YNR031C 4740 nt1.68□□□□□ -2.14
SSF2Q12153 LAA1YJL207C 6045 nt1.67□□□□□ -2.14
SSF2Q12153 YPL044CYPL044C 549 nt1.66□□□□□ -2.14
SSF2Q12153 RPL26BYGR034W 384 nt1.65□□□□□ -2.15
SSF2Q12153 YLL020CYLL020C 306 nt1.65□□□□□ -2.15
SSF2Q12153 SPC110YDR356W 2835 nt1.65□□□□□ -2.15
SSF2Q12153 SEC21YNL287W 2808 nt1.64□□□□□ -2.15
SSF2Q12153 CCH1YGR217W 6120 nt1.64□□□□□ -2.15
SSF2Q12153 GEA2YEL022W 4380 nt1.62□□□□□ -2.15
SSF2Q12153 UTP8YGR128C 2142 nt1.62□□□□□ -2.15
SSF2Q12153 COX5BYIL111W 456 nt1.62□□□□□ -2.15
SSF2Q12153 TRM732YMR259C 4263 nt1.62□□□□□ -2.15
SSF2Q12153 NUP157YER105C 4176 nt1.62□□□□□ -2.15
SSF2Q12153 YLR282CYLR282C 342 nt1.61□□□□□ -2.15
SSF2Q12153 PRP5YBR237W 2550 nt1.59□□□□□ -2.15
SSF2Q12153 HKR1YDR420W 5409 nt1.59□□□□□ -2.15
SSF2Q12153 YML002WYML002W 2214 nt1.59□□□□□ -2.15
SSF2Q12153 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.59□□□□□ -2.15
SSF2Q12153 PRP42YDR235W 1635 nt1.58□□□□□ -2.16
SSF2Q12153 PIK1YNL267W 3201 nt1.58□□□□□ -2.16
SSF2Q12153 BFR2YDR299W 1605 nt1.56□□□□□ -2.16
SSF2Q12153 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.56□□□□□ -2.16
SSF2Q12153 snR190snR190 190 nt1.56□□□□□ -2.16
SSF2Q12153 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.56□□□□□ -2.16
SSF2Q12153 STB6YKL072W 2301 nt1.56□□□□□ -2.16
SSF2Q12153 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.55□□□□□ -2.16
SSF2Q12153 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.53□□□□□ -2.16
SSF2Q12153 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.53□□□□□ -2.16
SSF2Q12153 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.53□□□□□ -2.16
SSF2Q12153 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.53□□□□□ -2.16
SSF2Q12153 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.53□□□□□ -2.16
SSF2Q12153 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.53□□□□□ -2.16
SSF2Q12153 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.53□□□□□ -2.16
SSF2Q12153 SEC8YPR055W 3198 nt1.52□□□□□ -2.17
SSF2Q12153 CDC39YCR093W 6327 nt1.5□□□□□ -2.17
SSF2Q12153 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.5□□□□□ -2.17
SSF2Q12153 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.5□□□□□ -2.17
SSF2Q12153 YGR130CYGR130C 2451 nt1.5□□□□□ -2.17
SSF2Q12153 FYV8YGR196C 2454 nt1.5□□□□□ -2.17
SSF2Q12153 IML1YJR138W 4755 nt1.49□□□□□ -2.17
SSF2Q12153 RAD9YDR217C 3930 nt1.48□□□□□ -2.17
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