Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 SLH1YGR271W 5904 nt2.75□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 PDR3YBL005W 2931 nt2.74□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 SEC7YDR170C 6030 nt2.74□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 IRE1YHR079C 3348 nt2.73□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 SYH1YPL105C 2550 nt2.73□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 TRL1YJL087C 2484 nt2.73□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt2.73□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 ECM29YHL030W 5607 nt2.73□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 GCN2YDR283C 4980 nt2.72□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 YOR296WYOR296W 3870 nt2.72□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 snR64snR64 101 nt2.72□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 snR47snR47 99 nt2.72□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 CDC60YPL160W 3273 nt2.71□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 FKS3YMR306W 5358 nt2.7□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 TOP2YNL088W 4287 nt2.7□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.7□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.7□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.7□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.7□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.7□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.7□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 YLR041WYLR041W 321 nt2.7□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 ORC3YLL004W 1851 nt2.7□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 GIP3YPL137C 3831 nt2.7□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 SPO24YPR036W-A 204 nt2.69□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 UFD4YKL010C 4452 nt2.69□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 FYV10YIL097W 1551 nt2.69□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 ALY2YJL084C 3141 nt2.68□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 ASE1YOR058C 2658 nt2.68□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 PET309YLR067C 2898 nt2.68□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 HIR3YJR140C 4947 nt2.68□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 YPL216WYPL216W 3309 nt2.67□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 TIM9YEL020W-A 264 nt2.67□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 NUM1YDR150W 8247 nt2.67□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 SGS1YMR190C 4344 nt2.67□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 ESL2YKR096W 3588 nt2.66□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt2.66□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 TCB2YNL087W 3537 nt2.66□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 TOF1YNL273W 3717 nt2.66□□□□□ -1.98
TFB4Q12004 snR50snR50 90 nt2.65□□□□□ -1.99
TFB4Q12004 RAV1YJR033C 4074 nt2.65□□□□□ -1.99
TFB4Q12004 RGA1YOR127W 3024 nt2.65□□□□□ -1.99
TFB4Q12004 FAR11YNL127W 2862 nt2.64□□□□□ -1.99
TFB4Q12004 SVL3YPL032C 2478 nt2.64□□□□□ -1.99
TFB4Q12004 RPS29AYLR388W 171 nt2.64□□□□□ -1.99
TFB4Q12004 BCK1YJL095W 4437 nt2.64□□□□□ -1.99
TFB4Q12004 PAN2YGL094C 3348 nt2.64□□□□□ -1.99
TFB4Q12004 SFB2YNL049C 2631 nt2.64□□□□□ -1.99
TFB4Q12004 NUT1YGL151W 3399 nt2.63□□□□□ -1.99
TFB4Q12004 RAD9YDR217C 3930 nt2.62□□□□□ -1.99
TFB4Q12004 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt2.62□□□□□ -1.99
TFB4Q12004 DNA2YHR164C 4569 nt2.61□□□□□ -1.99
TFB4Q12004 MSB2YGR014W 3921 nt2.61□□□□□ -1.99
TFB4Q12004 SSD1YDR293C 3753 nt2.6□□□□□ -1.99
TFB4Q12004 MYO2YOR326W 4725 nt2.6□□□□□ -1.99
TFB4Q12004 YPR097WYPR097W 3222 nt2.59□□□□□ -1.99
TFB4Q12004 SMC1YFL008W 3678 nt2.57□□□□□ -2
TFB4Q12004 YAR009CYAR009C 3591 nt2.57□□□□□ -2
TFB4Q12004 GYP5YPL249C 2685 nt2.57□□□□□ -2
TFB4Q12004 NOP9YJL010C 2001 nt2.57□□□□□ -2
TFB4Q12004 KRE33YNL132W 3171 nt2.57□□□□□ -2
TFB4Q12004 IRA2YOL081W 9240 nt2.56□□□□□ -2
TFB4Q12004 MMS4YBR098W 2076 nt2.56□□□□□ -2
TFB4Q12004 SEC10YLR166C 2616 nt2.56□□□□□ -2
TFB4Q12004 WAR1YML076C 2835 nt2.56□□□□□ -2
TFB4Q12004 RPM2YML091C 3609 nt2.56□□□□□ -2
TFB4Q12004 RPL26BYGR034W 384 nt2.55□□□□□ -2
TFB4Q12004 YDL073WYDL073W 2955 nt2.55□□□□□ -2
TFB4Q12004 UTP21YLR409C 2820 nt2.54□□□□□ -2
TFB4Q12004 snR190snR190 190 nt2.54□□□□□ -2
TFB4Q12004 AZF1YOR113W 2745 nt2.54□□□□□ -2
TFB4Q12004 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.53□□□□□ -2
TFB4Q12004 UBP3YER151C 2739 nt2.52□□□□□ -2.01
TFB4Q12004 RAD50YNL250W 3939 nt2.52□□□□□ -2.01
TFB4Q12004 RTT101YJL047C 2529 nt2.52□□□□□ -2.01
TFB4Q12004 KOG1YHR186C 4674 nt2.52□□□□□ -2.01
TFB4Q12004 AXL1YPR122W 3627 nt2.51□□□□□ -2.01
TFB4Q12004 TDA9YML081W 3756 nt2.51□□□□□ -2.01
TFB4Q12004 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt2.51□□□□□ -2.01
TFB4Q12004 YLR419WYLR419W 4308 nt2.51□□□□□ -2.01
TFB4Q12004 PDR11YIL013C 4236 nt2.5□□□□□ -2.01
TFB4Q12004 PIK1YNL267W 3201 nt2.49□□□□□ -2.01
TFB4Q12004 YER078W-AYER078W-A 165 nt2.47□□□□□ -2.01
TFB4Q12004 TRA1YHR099W 11235 nt2.47□□□□□ -2.01
TFB4Q12004 EMC5YIL027C 426 nt2.46□□□□□ -2.02
TFB4Q12004 MSH6YDR097C 3729 nt2.45□□□□□ -2.02
TFB4Q12004 NNF2YGR089W 2811 nt2.45□□□□□ -2.02
TFB4Q12004 BPH1YCR032W 6504 nt2.45□□□□□ -2.02
TFB4Q12004 KIP1YBL063W 3336 nt2.44□□□□□ -2.02
TFB4Q12004 VPS13YLL040C 9435 nt2.43□□□□□ -2.02
TFB4Q12004 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.43□□□□□ -2.02
TFB4Q12004 YKL225WYKL225W 348 nt2.43□□□□□ -2.02
TFB4Q12004 snR14snR14 160 nt2.43□□□□□ -2.02
TFB4Q12004 UBR2YLR024C 5619 nt2.43□□□□□ -2.02
TFB4Q12004 NUP170YBL079W 4509 nt2.41□□□□□ -2.02
TFB4Q12004 ROM2YLR371W 4071 nt2.41□□□□□ -2.02
TFB4Q12004 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt2.4□□□□□ -2.03
TFB4Q12004 CHS1YNL192W 3396 nt2.4□□□□□ -2.03
TFB4Q12004 SEC16YPL085W 6588 nt2.4□□□□□ -2.03
TFB4Q12004 REV3YPL167C 4515 nt2.4□□□□□ -2.03
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