Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KDSRQ06136 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms