Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP27A1Q02318 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms