Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PLCB3Q01970 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms