Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms