Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms