Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms