Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD3P84022 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD3P84022 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms