Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SUMO1P63165 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms