Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms