Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms