Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-21P61565 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-21P61565 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-21P61565 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-21P61565 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-21P61565 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-21P61565 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-21P61565 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-21P61565 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-21P61565 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-21P61565 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-21P61565 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-21P61565 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-21P61565 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-21P61565 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-21P61565 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-21P61565 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-21P61565 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-21P61565 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-21P61565 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-21P61565 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-21P61565 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-21P61565 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-21P61565 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-21P61565 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-21P61565 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-21P61565 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-21P61565 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-21P61565 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-21P61565 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-21P61565 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-21P61565 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-21P61565 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-21P61565 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-21P61565 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-21P61565 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-21P61565 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-21P61565 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-21P61565 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-21P61565 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-21P61565 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-21P61565 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-21P61565 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-21P61565 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-21P61565 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-21P61565 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-21P61565 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-21P61565 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-21P61565 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-21P61565 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-21P61565 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-21P61565 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-21P61565 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-21P61565 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-21P61565 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-21P61565 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-21P61565 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-21P61565 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-21P61565 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-21P61565 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-21P61565 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms