Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DEFA1P59665 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA1P59665 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms