Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms