Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRP11P59045 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms